9 december 2022

KROPPENS CELLER BEKÄMPAR VIRUS GENOM MUTATIONER

Enligt en ny studie från Göteborgs universitet, kan kroppens celler bekämpa coronaviruset genom att mutera det och göra det mindre skadligt.

Kroppen kan visserligen också göra det mer smittsamt och farligt, men det är vanligare att det blir mindre skadligt.

Ringlander, J., Fingal, J., Kann, H., Prakash, K., Rydell, G., Andersson, M., Martner, A., Lindh, M., Horal, P., Hellstrand, K., Kann, M., (2022-02-08), Impact of ADAR-induced editing of minor viral RNA populations on replication and transmission of SARS-CoV-2.

”Adenosine deaminases acting on RNA (ADAR) are RNA-editing enzymes that may restrict viral infection. We have utilized deep sequencing to determine adenosine to guanine (A→G) mutations, signifying ADAR activity, in clinical samples retrieved from 93 severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)–infected patients in the early phase of the COVID-19 pandemic. A→G mutations were detected in 0.035% (median) of RNA residues and were predominantly nonsynonymous. These mutations were rarely detected in the major viral population but were abundant in minor viral populations in which A→G was more prevalent than any other mutation (P < 0.001). The A→G substitutions accumulated in the spike protein gene at positions corresponding to amino acids 505 to 510 in the receptor binding motif and at amino acids 650 to 655. The frequency of A→G mutations in minor viral populations was significantly associated with low viral load (P < 0.001). We additionally analyzed A→G mutations in 288,247 SARS-CoV-2 major (consensus) sequences representing the dominant viral population. The A→G mutations observed in minor viral populations in the initial patient cohort were increasingly detected in European consensus sequences between March and June 2020 (P < 0.001) followed by a decline of these mutations in autumn and early winter (P < 0.001). We propose that ADAR-induced deamination of RNA is a significant source of mutated SARS-CoV-2 and hypothesize that the degree of RNA deamination may determine or reflect viral fitness and infectivity.”

Källa:

https://www.pnas.org/content/119/6/e2112663119

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras. Obligatoriska fält är märkta *

Genom att använda sidan, samtycker du till att all information som finns eller presenteras på denna webbplats inte är avsedd för någon form av diagnos, medicinsk behandling eller rekommendation, utan att den endast presenteras för utbildningsändamål av intresse för personligt bruk för läsaren, som själv tar fullt ansvar för dess användning. För ytterligare information och om sidans användande av så kallade kakor, GDPR, se även sidans  Integritetspolicy.